Index

A

add_content() (araucaria.main.group.Group method) add_group() (araucaria.main.collection.Collection method) add_midrule() (araucaria.main.report.Report method) add_row() (araucaria.main.report.Report method) align() (in module araucaria.xas.merge) apply() (araucaria.main.collection.Collection method) araucaria.fit module araucaria.fit.lcfit module araucaria.io module araucaria.io.io_hdf5 module araucaria.io.io_read module araucaria.io.io_write module araucaria.linalg module araucaria.linalg.la module araucaria.main module araucaria.main.collection module araucaria.main.dataset module araucaria.main.group module araucaria.main.report module araucaria.plot module araucaria.plot.fig_lcf module araucaria.plot.fig_stats module araucaria.plot.fig_xas module

araucaria.plot.template module araucaria.stats module araucaria.stats.cluster module araucaria.stats.genesd module araucaria.stats.pca module araucaria.stats.signal module araucaria.testdata module araucaria.testdata.utils module araucaria.utils module araucaria.xas module araucaria.xas.autobk module araucaria.xas.deglitch module araucaria.xas.merge module araucaria.xas.normalize module araucaria.xas.xasft module araucaria.xas.xasutils module araucaria.xrdb module araucaria.xrdb.chem module araucaria.xrdb.xray module at_weight() (in module araucaria.xrdb.chem) autobk() (in module araucaria.xas.autobk)

C

calibrate() (in module araucaria.xas.merge) check_objattrs() (in module araucaria.utils) check_xrange() (in module araucaria.utils) cluster() (in module araucaria.stats.cluster) Collection (class in araucaria.main.collection)

components (araucaria.stats.pca.PCAModel attribute) compute_bins() (in module araucaria.stats.signal) cond_num() (in module araucaria.linalg.la) convert_bytes_hdf5() (in module araucaria.io.io_hdf5) copy() (araucaria.main.collection.Collection method) (araucaria.main.group.Group method)

D

Dataset (class in araucaria.main.dataset) deglitch() (in module araucaria.xas.deglitch)

del_group() (araucaria.main.collection.Collection method) delete_dataset_hdf5() (in module araucaria.io.io_hdf5)

E

edge_energy() (in module araucaria.xrdb.xray)

etok() (in module araucaria.xas.xasutils)

F

fig_autobk() (in module araucaria.plot.fig_xas) fig_cluster() (in module araucaria.plot.fig_stats) fig_lcf() (in module araucaria.plot.fig_lcf) fig_merge() (in module araucaria.plot.fig_xas) fig_pca() (in module araucaria.plot.fig_stats) fig_pre_edge() (in module araucaria.plot.fig_xas) fig_target_transform() (in module araucaria.plot.fig_stats)

fig_xas_template() (in module araucaria.plot.template) FigPars (class in araucaria.plot.template) find_critvals() (in module araucaria.stats.genesd) find_e0() (in module araucaria.xas.normalize) find_ri() (in module araucaria.stats.genesd) formula_parser() (in module araucaria.xrdb.chem) formula_weight() (in module araucaria.xrdb.chem) ftwindow() (in module araucaria.xas.xasft)

G

genesd() (in module araucaria.stats.genesd) get_cols() (araucaria.main.report.Report method) get_group() (araucaria.main.collection.Collection method) get_mapped_data() (in module araucaria.xas.xasutils) get_mcer() (araucaria.main.collection.Collection method) get_mode() (araucaria.main.group.Group method) get_names() (araucaria.main.collection.Collection method)

get_rows() (araucaria.main.report.Report method) get_tag() (araucaria.main.collection.Collection method) get_testfiles() (in module araucaria.testdata.utils) get_testpath() (in module araucaria.testdata.utils) get_version() (in module araucaria.utils) Group (class in araucaria.main.group) guess_edge() (in module araucaria.xas.normalize)

H

has_ref() (araucaria.main.group.Group method)

I

imd() (in module araucaria.linalg.la) index_dups() (in module araucaria.utils) index_nans() (in module araucaria.utils)

index_nearest() (in module araucaria.utils) index_xrange() (in module araucaria.utils) interp_yvals() (in module araucaria.utils) inverse_transform() (araucaria.stats.pca.PCAModel method)

K

ktoe() (in module araucaria.xas.xasutils)

L

lcf() (in module araucaria.fit.lcfit)

lcf_report() (in module araucaria.fit.lcfit)

M

matrix (araucaria.stats.pca.PCAModel attribute) matrix_rank() (in module araucaria.linalg.la) merge() (in module araucaria.xas.merge) module araucaria.fit araucaria.fit.lcfit araucaria.io araucaria.io.io_hdf5 araucaria.io.io_read araucaria.io.io_write araucaria.linalg araucaria.linalg.la araucaria.main araucaria.main.collection araucaria.main.dataset araucaria.main.group araucaria.main.report araucaria.plot araucaria.plot.fig_lcf araucaria.plot.fig_stats araucaria.plot.fig_xas araucaria.plot.template araucaria.stats araucaria.stats.cluster araucaria.stats.genesd araucaria.stats.pca araucaria.stats.signal araucaria.testdata araucaria.testdata.utils araucaria.utils araucaria.xas araucaria.xas.autobk araucaria.xas.deglitch araucaria.xas.merge araucaria.xas.normalize araucaria.xas.xasft araucaria.xas.xasutils araucaria.xrdb araucaria.xrdb.chem araucaria.xrdb.xray

N

nearest_edge() (in module araucaria.xrdb.xray)

P

pca() (in module araucaria.stats.pca)

PCAModel (class in araucaria.stats.pca) pre_edge() (in module araucaria.xas.normalize)

R

read_collection_hdf5() (in module araucaria.io.io_hdf5) read_dnd() (in module araucaria.io.io_read) read_fdicts() (in module araucaria.utils) read_file() (in module araucaria.io.io_read) read_hdf5() (in module araucaria.io.io_hdf5) read_lcf_chisqr() (in module araucaria.io.io_read) read_lcf_coefs() (in module araucaria.io.io_read) read_p65() (in module araucaria.io.io_read) read_rawfile() (in module araucaria.io.io_read)

read_xmu() (in module araucaria.io.io_read) rebin() (in module araucaria.stats.signal) rename() (araucaria.main.group.Group method) rename_dataset_hdf5() (in module araucaria.io.io_hdf5) rename_group() (araucaria.main.collection.Collection method) Report (class in araucaria.main.report) residuals() (in module araucaria.fit.lcfit) retag() (araucaria.main.collection.Collection method) roll_med() (in module araucaria.stats.signal)

S

s (araucaria.stats.pca.PCAModel attribute) set_columns() (araucaria.main.report.Report method) set_header() (in module araucaria.io.io_write) show() (araucaria.main.report.Report method)

sum_references() (in module araucaria.fit.lcfit) summary() (araucaria.main.collection.Collection method) summary_hdf5() (in module araucaria.io.io_hdf5) symtoz() (in module araucaria.xrdb.chem)

T

tags (araucaria.main.collection.Collection attribute)

target_transform() (in module araucaria.stats.pca) transform() (araucaria.stats.pca.PCAModel method)

U

U (araucaria.stats.pca.PCAModel attribute)

V

variance (araucaria.stats.pca.PCAModel attribute)

Vh (araucaria.stats.pca.PCAModel attribute)

W

write_collection_hdf5() (in module araucaria.io.io_hdf5) write_file() (in module araucaria.io.io_write) write_hdf5() (in module araucaria.io.io_hdf5)

write_lcf() (in module araucaria.io.io_write) write_lcf_report() (in module araucaria.io.io_write) write_recursive_hdf5() (in module araucaria.io.io_hdf5) write_xmu() (in module araucaria.io.io_write)

X

xftf() (in module araucaria.xas.xasft) xftf_kwin() (in module araucaria.xas.xasft)

xftr() (in module araucaria.xas.xasft) xftr_kwin() (in module araucaria.xas.xasft)

Z

ztosym() (in module araucaria.xrdb.chem)